Miembros del Comité Permanente
Presidencia
Profª. Eva Alcón, rectora de la Universitat Jaume I
Vicepresidencia
Prof. José Antonio Mayoral, rector de la Universidad de Zaragoza
Prof.ª Rosa Visiedo, rectora de la Universidad CEU San Pablo
Vocalía
Prof.ª Amaya Mendikoetxea, rectora Universidad Autónoma de Madrid
Prof.ª Laia de Nadal, rectora de la Universitat Pompeu Fabra
Prof. Francisco Oliva, rector de la Universidad Pablo de Olavide
Prof. Vicente Atxa, rector de Mondragon Unibertsitatea
Delegada para Políticas de Igualdad
Prof.ª Laia de Nadal, rectora de la Universitat Pompeu Fabra
Delegado de la Presidencia para el desarrollo de la LOSU
Prof. José Luján, rector de la Universidad de Murcia
Secretaria General
Mª Teresa Lozano Mellado

Asamblea General

La Asamblea General constituye el máximo órgano de gobierno de Crue Universidades Españolas y está formada por los 77 rectores y rectoras de las universidades que integran ​​​la institución. Se encarga de planificar la organización, el funcionamiento y las actividades de la institución. A través de sus acuerdos y declaraciones, la Asamblea da a conocer su posicionamiento sobre los diversos temas que afectan a la Educación Superior.

Junta Rectora

La Junta Rectora es el órgano de gobierno y representación de la Asociación que representa y gestiona los intereses de la misma, de acuerdo con las disposiciones y directrices de la Asamblea General.  Está integrada por la Presidencia; dos Vicepresidencias; cuatro Vocalías; los Delegados o Delegadas, en un número máximo de tres, que no ostenten Vicepresidencias o Vocalías; las Presidencias de las Comisiones Sectoriales y la Secretaría General, que dispondrá de voz, pero no de voto.

Comité Permanente

El Comité Per​manente de Crue Universidades Españolas es el órgano que gestiona y representa los intereses de la institución de acuerdo con las directrices de la Asamblea General. Está compuesto por la Presidencia, dos Vicepresidencias, cuatro Vocalías, la Secretaria General y dos delegaciones de la Presidencia.